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Após o fim do incidente "Mayonaka TV",ocorrido em Inaba,uma cidade pequena do interior do Japão,ocorreu uma fuga dos Shadows que habitavam tal dimensão para outros lugares. Houve porém uma enorme concentração de Shadows em uma região específica. Iwatodai. Isso se deve ao fato de que Iwatodai foi o local onde ocorreu a luta entre os membros do S.E.E.S. contra a Dark Hour. Essa luta deixou vários rastros em relação aos Shadows na cidade. Esses rastros acabaram atraindo todos os shadows remanescentes de Inaba. Aconteceu porém um fato inquietante. Izanami,a deusa que criou a Mayonaka TV,após ter sido derrotada,previu que isso pudesse acontecer. Antes de ser derrotada,separou uma parte de sua consciência e poderes dentro de um Shadow único,conhecido como "Okami". Essa criatura então tinha poderes muito maiores que qualquer Shadow já pôde ter. Ele foi um dos que migrou para Iwatodai. Lá,usando os poderes,criou uma espécie de escudo,que impedia a entrada de qualquer outra pessoa além das que já haviam naquela cidade. Isso isolou Iwatodai. Embora fosse uma situação crítica,a população era incapaz de perceber tais mudanças. Para eles,o mundo continuava normal. Nisso,Philemon entrou em ação. Para tentar evitar o agravamento da situação,Philemon tomou uma atitude drástica. Ele separou as memórias de todos os Persona Users que já passaram pela sua tutela,na tentativa de gerar mais lugares dentro de Iwatodai,e assim,diminuir a velocidade com que a cidade iria ser consumida pelos Shadows. Embora uma boa atitude,isso também trouxe de volta os problemas antigos,como a presença de Tartarus e a Mayonaka TV. Izanami conseguiu o que queria,ela recriou tudo que tinha perdido naquela fatídica luta. Mas Philemon tinha um plano. Era algo muito maior do quê já tentara fazer,mas era uma necessidade. Ele juntou então suas energias,e transmitiu o dom de possuir um Persona à centenas de pessoas de uma vez só,e fez um pacto com Izanami. Ele não iria mais interferir diretamente na cidade,mas seus servos e as pessoas que agora possuem esse dom tem liberdade de entrar naquela cidade. Izanami aceitou,afinal,ela estava em uma situação de superioridade total,mas ainda não era capaz de interferir diretamente em Philemon. Dessa forma,Philemon se tornou passivo à situação. Sua última atitude foi grandiosa,porém. Ele fez com que todos os usuários de Persona fossem atraídos de uma forma ou de outra para Iwatodai. Assim,todos iriam convergir naquele ponto crítico e talvez fossem capazes de resolver esse gigantesco problema.